许多天然的生物活性肽具有免疫调节作用，其中不少小分子肽的化学组成和结构已经确定，它们有特异、安全和较高的免疫学特性，这些小分子肽对免疫力的改善有重要的意义。
具有免疫调节作用的生物活性肽，又称为免疫调节肽或免疫活性肽，免疫调节肽分布很广泛，这些免疫调节小分子肽有的来源于动物、有的来源于植物，包括生物体中天然存在的内源性免疫调节肽和天然的蛋白质经酶解生成的外源性免疫调节肽。内源性免疫调节肽包括细胞因子，是由免疫细胞(淋巴细胞、单核巨噬细胞等)及相关细胞(成纤维细胞、内皮细胞等)产生的调节细胞功能的高活性、多功能的小分子肽，如来源于骨髓的中性粒细胞中的防御素和胸腺分泌的胸腺肽等；还有作为神经递质或神经活动调节因子的神经多肽，如血管活性肠肽。
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外源性免疫调节肽直接或间接来源于动物或植物蛋白质，也包括昆虫、微生物等生物体产生的免疫调节肽。如，动物乳汁（尤其初乳）就可直接提供多种免疫调节肽；大豆蛋白和牛骨髓蛋白水水解得到的小分子肽；牛乳酪蛋白在动物胃肠道消化后可间接提供多种免疫调节肽；以及来源于海洋生物的化学结构新颖及特异的高活性、高药效的海洋免疫调节肽类等。
其实抗菌肽也是一类具有免疫调节作用的生物活性肽。大部分抗菌肽是由生物体内相应基因编码，经糖基化、羧基末端酰胺化等修饰而成，少部分抗菌肽则是蛋白质经蛋白酶作用后形成。因此，既包含有内源性活性肽，又包含有外源性活性肽。
当下人类对内源性免疫调节肽的临床研究较多，其生理意义已被医学界公认；但其含量极其微小，难以提取，价格昂贵，难以实现规模性生产和实际应用。而外源性免疫调节肽进人身体后，可发挥和内源性相似的生理作用，而且食物来源的活性肽原料很广泛，外源性免疫调节肽营养作用和免疫调节作用也逐渐受到重视。
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